L'oesophage
Il propulse les aliments jusqu'à l'estomac, où il s'abouche par le cardia. Il peut arriver que le cardia fonctionne mal ; alors les aliments s'accumulent dans l'oesophage jusqu'à être régurgités. Ce phénomène de débordement peut aussi se produire en raison de la compression de l'oesophage par une tumeur dans la cage thoracique ou de la persistance d'un arc vasculaire d'origine embryonnaire. A la longue, l'entassement des aliments provoque une dilatation de l'organe : on parle de mégaoesophage. En général, les chatons déglutissent sans problème le lait maternel, mais les troubles apparaissent lors du passage à une alimentation solide. Les cas les moins graves sont améliorés par des mesures diététiques et hygiéniques, mais le plus souvent le pronostic est sombre.
L'estomac
C'est le siège d'affections isolées aiguës ou chroniques, les gastrites, mais il participe aussi à bon nombre de phénomènes pathologiques plus généraux.
Une gastrite aiguë fait suite à l'ingestion de substances avariées, médicamenteuses, toxiques ou non alimentaires ; elle participe aussi au tableau clinique de nombreuses affections générales (allergie, affections du foie, des reins, du coeur, maladies infectieuses ou parasitaires).
Si les cas bénins ne résistent pas à un jeûne de 24 heures (pas davantage) et à une reprise progressive de l'alimentation, les plus graves nécessitent l'intervention du vétérinaire pour contrôler les vomissements et administrer un traitement dépendant de la cause de la gastrite.
Une gastrite chronique, accompagnée de vomissements occasionnels, d'amaigrissement et d'intolérance alimentaire, se rencontre également de façon isolée ou au sein d'un syndrome plus général.
Le contrôle à long terme passe non seulement par l'administration de médicaments, mais aussi par des mesures diététiques (aliments concentrés hypoallergéniques, distribués en plusieurs petits repas). Un diagnostic précis nécessite des examens complémentaires (radiographie, transit baryté, voire fibroscopie ou laparotomie exploratrice). Les ulcères gastriques sont peu courants et difficiles à mettre en évidence.
La torsion d'estomac, si redoutée dans l'espèce canine, est rarissime chez le chat.
L'intestin
L'intestin est susceptible d'héberger de nombreux parasites, les plus fréquents étant des vers tels que ascaris ou dipylidium. Ces indésirables sont à l'origine de diarrhées, de troubles digestifs et d'amaigrissement, et, s'ils sont très nombreux, ils peuvent même boucher complètement la lumière de l'intestin et provoquer une occlusion intestinale.