Les insectes sont attirés par la présence d'animaux, de stocks alimentaires, d'eaux stagnantes et de déjections ; ils provoquent des nuisances pour l'environnement (mouches, transmission de zoonoses) et pour l'élevage par leur rôle pathogène direct (les puces, par exemple) et comme vecteurs de parasites.
Les ouvertures des zones sensibles (maternité, quarantaine, cuisine) doivent être, dans la mesure du possible, protégées par des moustiquaires dont les mailles ne dépassent pas 2 mm et les portes par des rideaux de lanières en plastique.
Il convient aussi de ne pas privilégier les zones chaudes, humides et obscures propices au développement des insectes : paille, greniers et faux plafonds,
stockage alimentaire prolongé non protégé, poubelles.
Les lampes actiniques intégrant une résistance électrique foudroyant les insectes conviennent parfaitement aux locaux fermés. Elles sont néanmoins insuffisantes en extérieur où le recours à la lutte chimique s'avère souvent nécessaire.
Les puces sont des insectes et la lutte contre ce parasite passe par une désinfection efficace du milieu du chat qui peut être contaminé par tout animal extérieur à l'élevage (chien, exposition...).
Certains produits insecticides à appliquer sur les chats (à base de fipronil, d'imidaclopride) présentent une grande sécurité d'emploi et ont l'avantage d'être rémanents, c'est-à-dire de protéger contre les insectes durant un mois entier. D'autres molécules ont été développées, qui permettent d'effectuer une stérilisation des puces lors de la piqûre (lufénuron). Elles sont intéressantes en chatteries infestées, pour limiter la recontamination par l'environnement.
Le traitement de l'environnement peut se faire avec des foggers (pulvérisateurs à déclencher en l'absence des animaux), ou avec des solutions à pulvériser sur des parties particulièrement propices au développement des insectes : les faux plafonds, les boiseries et les rayonnages en tube creux ouverts. Les cadavres d'insectes seront aspirés avant de procéder au nettoyage et à la désinfection.