La bonne conduite d'un élevage exige en priorité de prévenir l'introduction de maladies dans l'effectif. Un autre principe de base consiste à ne garder pour la reproduction que des animaux dont le bon état de santé a été vérifié par des contrôles adéquats.
Une des difficultés du contrôle des maladies collectives félines réside dans l'existence, pour plusieurs infections, d'un stade de portage asymptomatique, non décelable par un examen clinique, mais qui correspond pour le chat à la possibilité de contaminer, à l'insu de tous, les congénères en contact avec lui (ex : portages herpétique et chlamydien et phase asymptomatique des infections rétrovirales).
De façon générale la vaccination des animaux n'est pas suffisante à elle seule pour protéger les effectifs des maladies et il est indispensable de prendre dans les chatteries des mesures hygiéniques dans le but de réduire la concentration en agents pathogènes dans le milieu extérieur : hébergement des animaux en cages individuelles à parois pleines, désinfection régulière des locaux et du matériel, isolement des malades et des nouveaux arrivants.