Elle se caractérise par une durée de plus d'un mois et par une tendance à la récidive. Les causes d'apparition sont quelque peu différentes du cas précédent. On trouve les inflammations de la muqueuse intestinale d'origine parasitaire ou allergique et auto-immune ; s'y ajoutent des défauts dans la sécrétion des enzymes digestives ou dans les mécanismes de l'assimilation des substances nutritives par les cellules intestinales. C'est pourquoi une diarrhée aiguë, qui a entraîné une destruction importante de la muqueuse digestive, peut évoluer vers un état chronique. Parfois, les diarrhées chroniques témoignent de la présence de tumeurs dans l'organisme. Enfin, comme dans le cas précédent, la diarrhée peut apparaître de façon intermittente lors d'un stress particulier et répétitif.
Dans le cas de la diarrhée chronique, l'état général de l'animal se dégrade doucement. Le chien s'amaigrit progressivement et dans des proportions plus importantes que lors d'une diarrhée aiguë. Par contre, la déshydratation se met en place plus tardivement et la douleur abdominale est souvent moins vive.
Comme pour les vomissements, il est important d'aller rapidement consulter un vétérinaire. En effet, la santé du chien peut vite se détériorer, et ce surtout chez les sujets jeunes ou âgés. Afin d'aider au mieux le praticien à établir un diagnostic, le propriétaire doit relever la date d'apparition des symptômes, la fréquence des selles, leur constance, leur couleur (il peut,par exemple, y avoir du sang). Les selles contiennent-elles des parasites ou des aliments non digérés ? Le chien exprime-t-il de la douleur ?
Chacun de ces éléments permet au vétérinaire de préciser l'origine exacte du problème, de prévoir les examens à réaliser et d'établir un traitement.
On peut recommander de faire observer une diète au chien, dès l'apparition de la diarrhée, et d'aller consulter un vétérinaire au plus vite.
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