L'intestin est le siège de la majeure partie de la digestion et de l'absorption des nutriments. Il forme des anses qui se distribuent dans la cavité abdominale : mesurant six fois la longueur du corps du chien, il est replié dans l'abdomen. L'ensemble des viscères abdominaux est enveloppé par le grand omentum, ou épiplon, qui permet de maintenir une certaine topographie constante des organes.
L'intérieur de l'intestin grêle est constitué de replis de la paroi : la surface d'absorption est ainsi augmentée. Les cellules constituant les microvillosités (ultimes repliements de la paroi au niveau cellulaire) n'ont pas le même rôle. Celles du bas sécrètent surtout du mucus et celles du haut absorbent les nutriments digérés. Par ailleurs, les cellules mortes, en se dégradant, libèrent d'autres types d'enzymes. Suivant la nature des digesta, l'absorption s'effectue de manière différente.
L'absorption des glucides
En ce qui concerne les glucides, les formes se trouvant dans l'intestin grêle sont des oses. Ils sont absorbés par les cellules intestinales. Ils se retrouvent dans les vaisseaux sanguins, très nombreux dans l'intestin grêle.
L'absorption des lipides
Les micelles sont absorbées par les cellules intestinales. Les différents constituants de ces micelles sont ensuite remaniés à l'intérieur des cellules pour redonner des triglycérides. Ceux-ci sont fixés à des protéines et d'autres molécules et sont repris par les vaisseaux lymphatiques de l'intestin grêle.
L'absorption des protides
Les acides aminés sont absorbés de façon complexe par les cellules de l'intestin. Cependant, Il existe aussi d'autres formes présentes dans la "lumière" Intestinale : les peptides qui sont des enchaînements plus ou moins longs d'acides aminés. Les plus courts, constitués de deux ou trois acides, peuvent être absorbés par un système actif. Ils sont alors hydrolysés par les enzymes des cellules. Ce sont donc des acides aminés qui sont retrouvés dans la circulation sanguine.